中文Nový koronavirový variantní kmen 501Y-V2 z Jižní Afriky
18. prosince 2020 detekovala Jižní Afrika mutantu 501Y-V2 nového koronaviru.Nyní se jihoafrický mutant rozšířil do více než 20 zemí.Experimenty ukázaly, že výše uvedené mutanty nového koronaviru mohou nést další varianty nového koronaviru mutací K417N/T, E484K a N501Y, které mohou snížit neutralizační schopnost vakcínou indukovaných plazmatických neutralizačních protilátek.Avšak ve srovnání s referenčním genomem Wuh01 (číslo sekvence MN908947) má sekvence 501Y.V2 jihoafrického mutantního genomu 23 nukleotidových variant.Má stejnou mutaci N501Y jako podtyp British mutant B.1.1.7, ale stále obsahuje mutace na dvou klíčových místech E484K a K417N proteinu S, které mají potenciálně důležité účinky na schopnost viru infikovat.
Nový koronavirus je jednovláknový RNA virus, jehož genomové mutace jsou častější.Jednocílová detekce může snadno vést k promeškané detekci vzorků s nízkou virovou zátěží a mutovaných virových kmenů.Míra opakovaného vyšetření u jednoho pozitivního v cílové detekci může dosáhnout více než 10 %, což může zvýšit pracovní zátěž a prodloužit dobu diagnózy.Detekce více cílů a vzájemné ověřování výsledků každého cíle může zvýšit míru detekce a usnadnit včasnou diagnostiku.
Obrázek 1. Schematický diagram mechanismu infekce nového koronaviru
Nový mutant koronaviru B.1.1.7 z Británie
26. prosince 2020 byla online zveřejněna první vědecká práce o kmeni B.1.1.7.Institute of Hygiene University of London UK and Tropical Diseases potvrdil, že kmen B.1.1.7 je schopnější šíření než jiné kmeny, což bylo více než 56 % (95 % CI 50-74 %).Protože tento nový mutantní kmen má zjevnější přenosovou sílu, je obtížnější kontrolovat COVID-19.Další den University of Birmingham ve Spojeném království nahrála článek na MedRxiv.Studie zjistila, že počet kopií genu ORF1ab a viru N u pacientů infikovaných mutantním kmenem B.1.1.7 (vypadnutí S-genu) byl významně zvýšen;tento jev byl v populaci sledován.Tento článek poukazuje na to, že pacienti infikovaní mutantem B.1.1.7 z Británie mají významně vyšší virovou zátěž, takže tento mutant může být také patogennější.
Obrázek 2. Sekvence genomové mutace obsažená v mutovaném kmeni koronaviru B.1.1.7 z Británie
Obrázek 3. Mutace N501Y se vyskytla jak v Británii, tak v Jižní AfriceVarianty
Detekční sada nových variant koronaviru
Společnost Chuangkun Biotech Inc. úspěšně vyvinula detekční sadu pro nové varianty koronaviru B.1.1.7 a 501Y-V2.
Výhody tohoto produktu: vysoká citlivost，současná detekce 4 cílů, pokrývající hlavní mutační místa mutantního kmene B.1.1.7 a 501Y.V2 jihoafrický mutantní kmen.Tato souprava dokáže simultánně detekovat místa mutace N501Y, HV69-70del, E484K a nový gen S koronaviru;Rychlý test: od odběru vzorku k výsledku trvá pouze 1 hodina 30 minut.
Obrázek 4. Detekce křivky amplifikace varianty COVID-19 Británie
Obrázek 5. Detekce amplifikační křivky jihoafrické varianty COVID-19
Obrázek 6. Křivka amplifikace nového koronaviru divokého typu
Není jasné, jak tyto mutace akumulují nový dlouhodobý dopad pandemického práva COVID-19.To nám ale připomíná, že tyto mutace mohou ovlivnit účinnost přirozené imunity a imunity vyvolané očkováním.Připomíná nám to také, že musíme nový koronavirus dlouhodobě nepřetržitě sledovat a aktualizovat vakcínu COVID-19, abychom se vypořádali s vývojem nového koronaviru.
Čas odeslání: 12. března 2021